Выставленные в музее экспонаты распределены по определенным секциям (доисторическая, топографическая) и сгруппированы по месту нахождения или раскопок.
В Секции доисторических экспонатов содержатся находки, относящиеся к периоду от палеолита до Железного века: слепки, оружие, предметы ручной выделки, кухонная утварь, вазы и затвердевшие остатки растений, а также кости из могил и пещер горы Амиата, из Питильяно и Четоны.
В многочисленных залах Секции топографии содержатся предметы, сгруппированные по месту нахождения. Наибольшее историческое значение имеют находки из зоны Кьюзи: каменные инструменты, бронзовые предметы, канопы, вазы из красной глины, терракота, урны, часто украшенные мифологическими сценами.
Большой интерес представляют также предметы (кроме ваз, урн с прахом и разного погребального снаряжения), найденные на территориях Кьянчано, Монтериджони, Сферракавалли, в имении Санто Полинари и в Валь-д'Эльза.
Следует обратить внимание на саркофаги; некоторые из них украшены прекрасными барельефами, в основном, с изображением сцен охоты. Один из самых интересных саркофагов под названием "Музе Киджи" был найден на Вилле Киджи близ Сиены. Важное значение имеют экспонаты, относящиеся к этрускам и древним римлянам. Из них особенно выделяется Голова Сенеки, римская копия с греческого оригинала с изображением известного в ту пору человека, может быть, это и Сенека. Ценная амфора IV века до н.э. с изображением (выполненным черным цветом) воина в коляске, окруженного сатирами и менадами.
В Археологическом музее есть также секция нумизматики, в которой выставлены монеты различных эпох, найденные на разных территориях страны, включая области Лацио, Умбрия и Марке.
